เรื่องย่อ Ben 10 Ultimate Alien ซีซัน 2 เป็นการต่อสู้ของเบ็นกับดากอน สิ่งมีชีวิตจากต่างมิติที่ต้องการยึดครองโลก โดยมีอัศวินตลอดกาลอย่างเซอร์จอร์จเป็นผู้กุมความลับในการต่อสู้กับดากอน และเบ็นได้ครอบครองดาบศักดิ์สิทธิ์ที่มีพลังทำลายล้างมหาศาล นอกจากนี้ เบ็นยังต้องรับมือกับปัญหาภายในของอัลติเมทริกซ์ที่พยายามยึดร่างของเขา และเผชิญหน้ากับวิลแก็กซ์ซึ่งดูดกลืนพลังของดากอนเข้าไป